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国子监的主管有德高望重的庞德公担任，其他一些名士担任副手。
刑部的主管依然是陈宫，早吕布手下的臣子中，对刑律的研究，似乎没有谁能超过他。按照吕布的指示，他在几年前就做了准备，准备了大量精通刑律的人才。吕布将刑法彻底分离出来，不再由地方官员继续担任。全国上下的案件，统一有刑部管理。因为准备充分，并没有引起太大的反弹。这项措施虽然加大了朝廷的开销，但也削弱了地方官员的权利，保证了百姓的利益。
在军事方面，吕布进行了一系列的人事任命，张辽等将领纷纷升职，但还没有到达一等征将军的程度，更不要说七等将军以上的大将军和元帅两个职位了。吕布这样做的目的，为的是吊众将的胃口，鼓励他们进一步建功利业。
吕布将兵部彻底拆分开来，设立统帅部,参谋部,作战部,后勤部,军情部和军工部六大部门。
为了保证部队的战斗力，吕布将部队分为陆军部,海军部和炮兵部等多个部门，但大秦现阶段的实力而言，陆军还是当之无愧的主力。所以吕布又在军部设立海军总监和海军大臣,陆军总监,陆军大臣,骑兵总监,步兵总监以及炮兵总监等一系列职务，分化将领权利，其品级与各部首脑相平，由高级将领或精通武事的高级文官担任。这些人平日里呆在统帅部里，总揽全局，为自己的手下争夺财政预算和军械。
参谋部主管研究战略，中、高级将领主要的活动场所就是这里，他们只有研究战略的权利，却没有实施战术和带兵的权利。当然他们一旦有什么新的战术设想，完全可以提出。同事，参谋部统帅部还掌握着低级军官的任命。因此，参谋部又称为帝国总参谋部，和统帅部一起，称之为军队的大脑。
作战部则是那些中、低级军官活动的场所，他们平日里练兵，或到这里接受培训，学习新的战术，了解新的武器，他们是军队的四肢，小规模的军事行动，他们将最先出动。
后勤部的作用在军队中不言而喻。他担负着军队的血线。无论是兵器盔甲，还是军饷粮秣，都离不开后勤部的调拨，可以说，后勤部掐着整个部队的命脉。
军情部的作用更大，他和吕布手下另一只情报部队――――鼹鼠齐名，都是担任情报搜集工作的。只不过没有鼹鼠部队的覆盖面那么广，他们只搜集军事情报，以保证了解敌人的情况。
军工部是五大部门中，最特殊的一个部门，他们的作用同样不小，如同人体五脏六腑一样，离开哪个都不成。他控制着几乎所有的军工部门，负责向总参谋部提供部队所需要的装备，同时和科研部相联系，进一步改进武器装备，提高武器质量，以武装部队。
借助改革的机会，吕布整编了全国的部队，裁撤了全部的地方部队和一大批士兵。国家已经很安定了，眼下需要的是休养生息，根本没有必要保留那么多部队。到最后，他只下令保留五十万精锐陆军和十万水军，他手下的现役部队，都是百战雄师。
至于监察机构，则是独立的部门，他们有权举报任何官员的违法行为，在证据却凿的情况下，他们可以对官员进行调查，一旦成立，则移交刑部，由刑部审理。同时，吕布还给了他们一个巨大的权利，监督君主，以规范君主的行为。
吕布这一系列举动，就如同一记记重拳，将很多人都打得晕了。所有人都意识到，吕布作为一个强势君主，根本不会甘于沉默。
几家欢喜几家愁，吕布登基，并进行一系列改革的事，让一些仇视大秦的人心惊肉跳。江东以及刘备的余孽联合到了一起，可即使是这样，也没有多少人，加起来也不过十几个人，外加数百杂鱼，他们在等待机会，一个可以反盘的机会。用司马徽的话来说，那就是大秦就像兔子的尾巴，长不了，早晚要步上先秦的后尘------
大秦的辉煌之下，并不是平安无事，在看似平静的水面，还潜藏着暗流。
