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飞快地给勋贵定罪之后，朱皇帝就继续了对其余中枢部门的整肃。
对兵部的整肃，和改制基本上是同步进行的。
只是把兵部稍微一查，就让朝堂上的重臣们脸上火辣辣地疼。
武官的人事和功赏等事，被武选和职方两清吏司折腾得可以说是一团糟。没有关系、不送钱的武将，可以说根本就没法在军中立足，没有大佬罩着，又不肯送钱，就算你立功了，想升官这辈子都是不可能的。
武库清吏司管着的仓库，武器都是破烂，各种账目稍微一查就能找出一堆的漏洞。
车驾司勾结太仆寺，在军马上做假账，以次充好，他们管理的驿站更是稀烂，大量关系户被送进去当驿丞。
对兵部的初步清洗开始后不久，朱皇帝就把朝堂上的重臣们都召集了在一起，然后把一堆的案件卷宗丢到了他们面前。
“你等都瞧瞧，我大明满朝上下，有几人不贪，不受贿？户部、兵部之中，有几人干净？如今朕还只是查到了户部与兵部头上。接下来，又要查出多少贪官污吏？中枢如此，地方上是何种模样还用多想？”
说着，他环视了一圈。
此时，内阁、九卿和六科等重要官员，早就全部跪下。
“以朕看，我大明如今便到了末世。要不了多久，各处百姓便不堪忍受，会纷纷揭竿而起。若朕再放纵贪腐，天下大乱之后，就必有英雄出，兴仁义之师，吊民伐罪，让朕与诸位中的多数人，都死无葬身之地！”
这话可以说重极了，吊民伐罪都说出来了，完全是把眼下的大明朝廷彻底定性成了残虐百姓的反派。
“陛下为此言，臣死罪。”
一众大臣们，这会才算是明白皇帝为何这么激进。
皇帝原是觉得大明烂透了，再不整治，这大明就药丸。
他们虽说不完全认同这一点，但最近的诸多大案，又让他们不好反驳。他们当然清楚大明很烂，但是完全没想到，大明已经烂到了这个地步。
“你等回去把朕的话，都好好想想。告诉你等在地方上的亲友，他们要造反，就趁早跳出来。朕不怕。”
一众大臣们，只得唯唯诺诺地退下。
随着大批官吏入狱，兵部下属的职方清吏司被彻底废除，武选清吏司的职权也被直接砍了一刀，武库清吏司也被并入了后勤清吏司，车驾清吏司暂时保留。
太仆寺既然都被查出来有问题，朱皇帝自然不会放弃，很快整个太仆寺衙门上下的官吏就无一例外地落马。
太仆寺全体官员都落马之后，朱皇帝就召集几位重臣，开始讨论马政和太仆寺的问题。
一开始，朱皇帝就问道：“国朝设太仆寺，所为者无非军马，如今太仆寺为何变为了钱粮衙门？”
李起元站出来说道：“太仆寺马原本专给团营骑操，自从官养马场废弛之后，就改成把官马分派给民户饲养，过一定时期征收约定马匹之政，这便是所谓的俵马法。由于官吏易于借征马盘剥马户，不能得马，不久也废弛。
之后，太仆寺征收也逐渐变为折色，牧马草场也多租给百姓收租，种马变卖后向百姓收草料银。
自从行太仆寺废，西北苑马寺废后，除辽东少求于中枢外，各边军之马也皆仰给于太仆寺。边军和京营上报缺额，由兵部会同科道官审核，太仆寺发银，在科道监督下购买马匹。”
朱皇帝闻言点了点头，说道：“朕记得没错的话，这马户上交的折色银，原来应该就是民户免去的国税徭役是吗？”
汪应蛟出列点头说道：“当日太祖以为，马政乃国之重者，古人先马而后钱粮，故数马以对。为使得百姓能专注养马，故豁免了马户的正税和各项差役。”
朱皇帝又问道：“汪爱卿，据朕所知，这马户每岁征草料银一两，每三年征收马匹一匹，折色20两。也就是说，每户每岁要征收数两银子。这比平常民户的赋役起码高出了一倍不止。这难道不是恶政？朕以为，当废除马户，将其编入民户。”
汪应蛟闻言脸上立刻浮现出了喜色，太仆寺这征收太狠，也不是第一次有人反映，不过看在每年收的大几十万两的银子的份上，皇帝根本不会去理会，现在这些马户总算是不用再被朝廷盘剥了。
“陛下圣明。”
朱皇帝接着说道：“太仆寺既无马，也养不得马，继续存在，也是多一些冗官，不如就此废除。其名下牧马草场，暂且归为官田，之后便逐渐发卖于百姓。”
反正，太仆寺在中枢的人员，都被皇帝一锅端了，再多说也没什么意思。皇帝的态度十分坚决，冗官这话都说出来了，这些文官们，也不敢拿祖制和马政不可废这类站不住脚的理由反对。
内地基本上早就没有人养马了，太仆寺的草场如今都是什么用途，在座的自然都是一清二楚。变为官田后发卖，不少官员是有点意见的，不过皇帝明显就是打算把全国的官田都废了，改革的态度比张居正坚决多了，明显是清楚官田这玩意稍有放松监管就会变成什么鬼样子，他们当然不敢站出来反对，官田的利益是让很多官员不愿意放手，得罪那帮人在以往后果很严重，然而到了如今这份田地上，那帮人都不知能有几个保住官身。
太仆寺现在职能也是和户部重合，朱皇帝早就琢磨着要把这个衙门直接撤销。
他当然不会在内地养马，因为那根本就是和人争食，在即将到来的大旱灾下，那根本是杀人。没有马，暂时可以直接去蒙古买，之后把蒙古彻底消化，大明自然有的是土地养马。
辽东的苑马寺在辽沈失陷后，就自动废除。至此，大明所有官方的马政管理机构，就全部被废除。之后，朱皇帝也不会继续搞什么封建官管马政，这事也就是汉代稍微搞得好点，其他王朝都是把马政管得一团糟。
军马的问题，朱皇帝倒是不大担忧，日后消化掉了蒙古，大明就不会再缺军马。他现在发展的，主要都是民间也用得着的拉货和耕地用的挽马。
